Georg Johann II. markiert als nachgeborener Sohn von Pfalzgraf Georg Johann I. und der schwedischen Prinzessin Anna Maria Wasa eine Phase der dynastischen Verzweigung innerhalb des Hauses Pfalz-Veldenz. Nach dem Tod des Vaters und der damit einhergehenden Teilung der väterlichen Hinterlassenschaft übernahm er die Herrschaft über die Territorien von Pfalz-Lützelstein und Pfalz-Guttenberg.

Sein Handeln war maßgeblich durch das Bestreben geprägt, die wirtschaftliche Handlungsfähigkeit seines kleinen Herrschaftsgebiets inmitten der immensen Schuldenlast zu sichern, die er von seinem Vater übernommen hatte. Gemeinsam mit seinen Brüdern trug er die Last einer prekären finanziellen Situation, die weite Teile seiner Regierungszeit überschattete.

Trotz dieser schwierigen Ausgangslage widmete er sich der administrativen Konsolidierung seiner Gebiete. Seine Regentschaft steht exemplarisch für die Herausforderungen kleinerer Fürstentümer im Zeitalter des Konfessionalismus, in denen das dynastische Überleben oft nur durch diplomatisches Taktieren und sparsame Haushaltsführung gesichert werden konnte. Durch seine Ehe mit Susanna von Pfalz-Sulzbach knüpfte er wichtige Verbindungen innerhalb der pfälzischen Linien der Wittelsbacher, auch wenn die Linie Pfalz-Lützelstein mit seinem Ableben mangels männlicher Erben bereits wieder im Mannesstamm erlosch. Die Territorien fielen daraufhin an seinen Bruder Leopold Ludwig zurück, womit die kurzzeitige territoriale Eigenständigkeit Lützelsteins endete.